Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMAPO00193 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMAPO00193 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMAPO00193 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAPO00193 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAPO00193 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAPO00193 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAPO00193 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAPO00193 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAPO00193 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAPO00193 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAPO00193 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAPO00193 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAPO00193 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAPO00193 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAPO00193 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAPO00193 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAPO00193 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAPO00193 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAPO00193 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAPO00193 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAPO00193 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAPO00193 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms