Protein–RNA interactions for Protein: E2RYF7

HCG22, Protein PBMUCL2, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG22E2RYF7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HCG22E2RYF7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HCG22E2RYF7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms