Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms