Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms