Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms