Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms