Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL469P-201ENST00000621501 237 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC100757.2-201ENST00000622316 280 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM166B-207ENST00000639789 651 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RDM1-229ENST00000639942 420 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAGI2-236ENST00000637441 5822 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 IQCA1-204ENST00000409907 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 BRCA1-208ENST00000468300 3273 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM246-201ENST00000374847 4223 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTC31-201ENST00000233623 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 VPS11-207ENST00000620429 2739 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 SRCAP-202ENST00000395059 9126 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPB41L2-216ENST00000527411 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 STAU1-207ENST00000371856 3684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAN2-209ENST00000548043 4641 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNMA1-259ENST00000639406 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADIPOQ-201ENST00000320741 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AMPH-201ENST00000325590 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZAN-204ENST00000546292 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 URGCP-202ENST00000402306 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 BMF-202ENST00000397573 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 LGALS8-219ENST00000526589 6420 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF548-202ENST00000366197 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAD17-205ENST00000354868 3060 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTC3-202ENST00000355666 7712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 LPAR6-202ENST00000378434 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MCF2-209ENST00000520602 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNXB-201ENST00000375244 13132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBE2V2-207ENST00000523111 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC6A4-201ENST00000261707 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA0319-202ENST00000430948 6620 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAPGEFL1-201ENST00000264644 3429 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM255A-203ENST00000371369 3425 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 DMXL2-201ENST00000251076 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 POTEF-202ENST00000409914 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM13C-217ENST00000618804 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD302-201ENST00000259053 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NET1-202ENST00000380359 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA1841-203ENST00000402291 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 KDM4A-201ENST00000372396 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AK3-204ENST00000611749 4029 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RHBDF2-201ENST00000313080 3582 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PALB2-206ENST00000568219 3963 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYH11-203ENST00000452625 6886 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 WSCD2-207ENST00000549903 3534 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SALL1-201ENST00000251020 5146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 GAREM1-201ENST00000269209 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CELF1-215ENST00000532048 3044 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF4E2-202ENST00000409098 3448 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CNTN4-205ENST00000427331 4980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLU7-201ENST00000297151 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004147.2-201ENST00000583224 3753 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 GLI1-207ENST00000543426 3394 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMIM19-204ENST00000438528 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIP-201ENST00000257979 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARIH2-201ENST00000356401 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPR107-201ENST00000347136 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM196-202ENST00000405844 4054 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 IPO4-201ENST00000354464 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYT1L-203ENST00000407844 3642 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TBX19-201ENST00000367821 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBM7-209ENST00000624815 3587 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 HHAT-207ENST00000541565 3164 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SP100-201ENST00000264052 3882 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA1644-201ENST00000381176 6751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 HMGCR-201ENST00000287936 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR219A1-201ENST00000362166 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms