Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 NBPF15-206ENST00000581897 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 PTPRB-209ENST00000550857 5839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 SERPINB13-201ENST00000269489 3206 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 MAPK10-272ENST00000641110 2724 ntAPPRIS P2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 TROVE2-205ENST00000367446 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 BCRP8-201ENST00000412037 255 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 PGAM1P3-201ENST00000420790 565 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC022730.2-201ENST00000465359 452 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 GAPDHP38-201ENST00000503632 1002 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC100823.2-201ENST00000518337 699 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 NUTF2P2-201ENST00000551207 384 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC044860.3-201ENST00000559957 368 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC007136.1-201ENST00000589141 199 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC129492.5-201ENST00000603489 315 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.27-201ENST00000617573 258 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 NFIB-205ENST00000380959 8198 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 CNOT4-201ENST00000315544 3783 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 ZNF438-203ENST00000375311 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 TTC9C-202ENST00000316461 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 REG3G-203ENST00000409471 575 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 RN7SL91P-201ENST00000469313 291 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 RN7SL635P-201ENST00000492123 296 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 KDM1B-203ENST00000546309 496 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 BOLA2P1-201ENST00000584794 232 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 OR6L2P-201ENST00000608207 925 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC129908.1-201ENST00000624553 648 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms