Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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