Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms