Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms