Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms