Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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