Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms