Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms