Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms