Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms