Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBE1Q9UJT0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms