Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SALL4Q9UJQ4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms