Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms