Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms