Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK-18Q9QC07 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms