Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRP2BPQ9P2M1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms