Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC10Q9NYD6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms