Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ECHDC1Q9NTX5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms