Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms