Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms