Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms