Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNMDQ9H2S6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNMDQ9H2S6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNMDQ9H2S6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNMDQ9H2S6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNMDQ9H2S6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNMDQ9H2S6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNMDQ9H2S6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNMDQ9H2S6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms