Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms