Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms