Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOPXQ9BPY8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms