Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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