Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms