Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms