Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms