Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms