Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms