Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms