Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF8

DEDD2, DNA-binding death effector domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEDD2Q8WXF8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEDD2Q8WXF8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEDD2Q8WXF8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEDD2Q8WXF8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEDD2Q8WXF8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEDD2Q8WXF8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEDD2Q8WXF8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEDD2Q8WXF8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEDD2Q8WXF8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEDD2Q8WXF8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEDD2Q8WXF8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEDD2Q8WXF8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEDD2Q8WXF8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEDD2Q8WXF8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEDD2Q8WXF8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEDD2Q8WXF8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEDD2Q8WXF8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEDD2Q8WXF8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEDD2Q8WXF8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEDD2Q8WXF8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms