Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms