Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms