Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms