Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
YTHDF3Q7Z739 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF3Q7Z739 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms