Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms