Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms