Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms