Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms