Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms