Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms